GISA is het overkoepelende ontwerp voor de inrichting en ontwikkeling van het gezondheidsinformatiestelsel. Als overkoepelende stelselarchitectuur beschrijft GISA hoe de verschillende onderdelen van het informatiestelsel samenhangen en op elkaar aansluiten. GISA zorgt voor consistentie tussen de verschillende deelarchitecturen, afsprakenstelsels, infrastructuren en voorzieningen die samen het gezondheidsinformatiestelsel vormen. Twiin en de GISA versterken elkaar. Twiin kan de GISA voeden met concrete praktijkervaring, bestaande afspraken en inzicht in de uitvoerbaarheid van landelijke gegevensuitwisseling. Daarmee helpt Twiin om de GISA toepasbaar en implementeerbaar te maken. Omgekeerd biedt de GISA aan Twiin een breder architectonisch kader waarbinnen Twiin haar rol, scope en doorontwikkeling kan bepalen. De GISA helpt Twiin om zich te positioneren als onderdeel van een samenhangend gezondheidsinformatiestelsel, in verbinding met generieke functies, andere afsprakenstelsels en publieke sturing. De kern is dat in Twiin concrete landelijke afspraken en specificaties worden vastgelegd en praktijk en uitvoeringskracht inbrengt, terwijl de GISA zorgt voor architectuurkaders, inrichtingskeuzes en afspraken voor samenhang, richting en stelselmatige bestuurlijke verankering. Twiin zal meegroeien met de principes en de gemaakte keuzes van de GISA.